Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra4Q9JJT2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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