Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl28Q9JIL2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms