Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms