Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SgshQ9EQ08 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SgshQ9EQ08 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SgshQ9EQ08 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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