Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms