Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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