Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Znf580Q9DB38 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Znf580Q9DB38 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Znf580Q9DB38 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Znf580Q9DB38 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Znf580Q9DB38 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Znf580Q9DB38 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Znf580Q9DB38 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Znf580Q9DB38 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf580Q9DB38 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms