Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmuQ9DAT5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TrmuQ9DAT5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TrmuQ9DAT5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TrmuQ9DAT5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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