Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg7Q9D906 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms