Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nop56Q9D6Z1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nop56Q9D6Z1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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