Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23bQ9D662 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms