Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PrameQ9D4Z5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrameQ9D4Z5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms