Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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