Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx29Q9D3S3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms