Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms