Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Necap2Q9D1J1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms