Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms