Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mis12Q9CY25 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms