Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms