Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms