Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Ms4a6cQ99N08 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a6cQ99N08 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ms4a6cQ99N08 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms