Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ms4a4dQ99N05 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms