Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tdrd1Q99MV1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms