Protein–RNA interactions for Protein: Q99LP6

Grpel1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel1Q99LP6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grpel1Q99LP6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grpel1Q99LP6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms