Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms