Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lactb2Q99KR3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.7 ms