Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ctu1Q99J10 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctu1Q99J10 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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