Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbox1Q924Y0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms