Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Supt16hQ920B9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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