Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek8Q91ZR4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek8Q91ZR4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek8Q91ZR4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms