Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd3Q91WC0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms