Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp3Q91W36 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp3Q91W36 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp3Q91W36 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp3Q91W36 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp3Q91W36 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp3Q91W36 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp3Q91W36 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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