Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sgms1Q8VCQ6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgms1Q8VCQ6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sgms1Q8VCQ6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgms1Q8VCQ6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgms1Q8VCQ6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sgms1Q8VCQ6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sgms1Q8VCQ6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgms1Q8VCQ6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms