Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd3Q8K2F0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms