Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c1Q8K193 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms