Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pkn3Q8K045 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pkn3Q8K045 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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