Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms