Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog3Q8CI04 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms