Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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