Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms