Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phtf2Q8CB19 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms