Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Dclre1bQ8C7W7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclre1bQ8C7W7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclre1bQ8C7W7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclre1bQ8C7W7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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