Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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