Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp398Q8BV16 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms