Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop53Q8BK35 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms