Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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