Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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