Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2q1Q7TSS2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2q1Q7TSS2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms