Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdp1Q7TSG2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctdp1Q7TSG2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms