Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snd1Q78PY7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snd1Q78PY7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms